16 марта 2004 года на базе СОШ № 39 прошёл семинар для заместителей директоров по учебно-воспитательной работе по теме: «Система управления учебно-воспитательным процессом: контрольно-диагностическая деятельность в повышении качества образования». В нем приняли участие более 50 представителей общеобразовательных учреждений города Чебоксары. Семинар открыла Коновалова Н.А., методист Информационно-методического центра при управлении образования администрации города Чебоксары. Вступительное слово было предоставлено директору СОШ № 39 Михайлову Вениамину Васильевичу, который рассказал о системе управления образовательным процессом в СОШ № 39. Первый блок семинара «Повышение уровня профессиональной деятельности учителей» включил практическую часть, на которой педагогами школы были показаны фрагменты уроков по нескольким направлениям:

1.      Педагогические технологии на основе активизации и интенсификации деятельности учащихся (игровые технологии) Перешигова И.А., учитель русского языка, Александрова И.В., учитель биологии, Васильева Н.К., учитель математики.

2.      Педагогические технологии на основе эффективности управления и организации учебного процесса (групповые технологии) Щетинина Л.С., учитель английского языка, Яковлева Л.В., учитель истории, Тамахина Р.П., учитель английского языка.

3.      Нетрадиционные методы и формы обучения (урок-проект, урок-зачёт). Пайгусова И.В., учитель математики, Чопенко Л.С., учитель географии, Петрова Н.Ф., учитель русского языка.

4.      Технология развивающего обучения. Тимофеева С.Г., учитель начальных классов, Завадская К.Н., учитель начальных классов.

Второй блок «Управление развитием инновационного учебного заведения» состоял из выступлений заместителей директора СОШ № 39:

1.      Направление педагогического мониторинга (зам. директора по НМР Рыжкова Л.В.)

2.      Сохранение и укрепление физического и психического здоровья детей (зам. директора по ВР Крючкова В.Г., зам. директора по УВР Тихонова А.В.)

3.      Контрольно-диагностическая деятельность по качеству преподавания, обучения (Зам. директора по УВР Бодрова Т.П., зам. директора по УВР Земскова А.В.)

4.      Наличие возможностей для творческого развития учащихся (учитель русского языка и литературы, руководитель МО Буданцова А.А.)